Considere um conjunto de dados de expressão gênica de 12.000 genes em 100 amostras de tecido, de indivíduos- controle e doentes. Qual das seguintes técnicas de análise de dados biológicos multidimensionais é a mais adequada para identificar os genes que estão diferencialmente expressos entre as duas condições?

O diretor de uma Unidade de Pronto-Atendimento (UPA) pediu de forma cortês ajuda a um colega, responsável pelos agendamentos e encaminhamentos de exames da UPA, para um favorecimento na fila de espera para realização de um exame de imagem de um amigo, o qual está com urgência na obtenção deste para continuidade de tratamento médico. Baseando-se no Decreto nº 1.171/1994, que descreve sobre a Ética Profissional do Servidor Público Civil do Poder Executivo Federal, considere as condutas abaixo.

I - Atender imediatamente ao pedido do diretor, pois é um dos deveres do servidor público ter respeito à hierarquia.

II - Atender ao pedido do diretor, pois é dever do servidor público ser probo, reto, leal e justo, e o atendimento do pedido será benéfico à saúde de um cidadão.

III - Não atender ao pedido do diretor, pois trata-se de uma vantagem indevida, e denunciá-lo.

IV - Não atender ao pedido do diretor, pois é um dos deveres do servidor público exercer com estrita moderação as prerrogativas funcionais que lhe sejam atribuídas, abstendo-se de fazê-lo contrariamente aos legítimos interesses dos usuários do serviço público.

Quais são condutas corretas desse servidor diante do pedido do diretor?

Montagens de genomas bacterianos, a partir de dados de NGS (Next Generation Sequencing), podem ser realizadas por duas principais abordagens: de novo ou mapeamento por referência. Abaixo são apresentadas possíveis etapas de um pipeline para montagem de um genoma bacteriano, a partir de sequências provenientes de um sequenciamento em uma plataforma NGS. Sobre esse tema, assinale a afirmativa correta.

Em um conjunto de genomas totais sequenciados de pacientes com diferentes tipos de tumores, será realizada a análise de eventos epigenômicos presentes nesses genomas. Para essas buscas, é correto afirmar

Um pesquisador recebeu dados de um projeto contendo short, long e ultra-long reads advindas de sequenciamentos de genomas humanos. O primeiro objetivo do pesquisador é empregar um montador híbrido para a montagem dos genomas. Para isso, o pesquisador deve observar

A triagem virtual de fármacos (virtual screening) é uma técnica que utiliza modelos computacionais para identificar compostos químicos com potencial para atuar como fármacos. A simulação de atracamento molecular é um processo computacional que simula a interação entre o composto químico e o alvo molecular. Sobre esta etapa, qual das seguintes afirmações é INCORRETA?

Considere uma rede de interações proteína-proteína (PPI) com 200 proteínas. As proteínas são representadas por vértices, e as interações, por arestas. Considere as seguintes afirmações sobre a análise topológica das redes.

I - A análise de centralidade (centrality analysis) fornece uma estimativa da importância de um vértice para a conectividade ou fluxo de informações da rede.

II - O grau das arestas pode ser usado como uma estimativa aproximada da centralidade.

III - A centralidade de proximidade (closeness centrality) é uma medida que estima a rapidez com que o fluxo de informações passa por um determinado vértice para outros vértices.

IV - A rede obtida é necessariamente acíclica.

V - Os vértices com alta centralidade de intermediação (betweenness centrality) oferecem informações sobre o controle do fluxo de informações. Esses nós podem representar proteínas importantes nas vias de sinalização e podem formar alvos para a descoberta de medicamentos.

Quais estão corretas?

Considere as seguintes afirmações sobre redes biológicas.

I - Redes de coexpressão representam as interações entre genes com base na correlação entre seus níveis de expressão.

II - Redes de interações proteína-proteína representam as interações diretas entre proteínas.

III - Redes de interações entre genes e proteínas representam as interações indiretas entre genes, mediadas por proteínas.

IV - Análises de redes biológicas podem ser usadas para identificar genes ou proteínas com funções importantes em um sistema biológico.

Quais estão corretas?

Um bioinformata recebeu dados de polimorfismos de nucleotídeo único de 300 pacientes saudáveis e de 1.200 pacientes com uma doença neurodegenerativa. Foi utilizado o algoritmo Random Forest para indução de um modelo lógico-matemático de classificação. Qual das seguintes métricas é a mais confiável para avaliar a qualidade do classificador induzido?

Um pesquisador decidiu usar técnicas estatísticas para identificar genes que estão associados a um determinado tipo de doença. O pesquisador obteve dados de expressão gênica de pacientes com a doença e de uma amostra de pacientes saudáveis. Ele usou um teste de hipótese para comparar a expressão gênica nas duas condições. O teste de hipótese fornece um p-valor de 0,05. Sobre uma possível conclusão desse teste, assinale a alternativa correta.