Um bioinformata está utilizando um pipeline para mineração de dados para identificar genes que estão associados a um determinado tipo de câncer. O pipeline utilizado, neste estudo, consiste em cinco etapas. Em qual delas o bioinformata está mais propenso a cometer um erro que pode levar a resultados incorretos?

Uma enfermeira de um hospital, no seu penúltimo dia de férias, sofreu um acidente com uma faca, o que gerou uma lesão na mão direita, que infeccionou. Para o retorno ao trabalho, conforme a Norma Regulamentadora nº 32 (NR-32) – Segurança e saúde no trabalho em serviços de saúde –, que prevê medidas de proteção contra riscos biológicos, a enfermeira deve

Os estudos de sequenciamento genético iniciaram-se na década de 1970. Desde então, as tecnologias de sequenciamento vêm evoluindo e permitindo expressivos avanços nas mais deferentes áreas do conhecimento. Analise as seguintes afirmativas referentes às metodologias de sequenciamento de ácidos nucleicos atualmente disponíveis.

I - As tecnologias de sequenciamento de ácidos nucleicos denominadas de NGS (Next Generation Sequencing) apresentam como grande diferencial o processamento massivo de amostras, que é possível pelo uso de adaptadores específicos e determinados para cada tecnologia.

II - Metodologias de segunda e terceira geração de NGS são baseadas na amplificação dos ácidos nucleicos a serem sequenciados, sendo essa amplificação essencial para a captação do sinal de leitura em equipamentos de ambas as gerações.

III - A tecnologia de sequenciamento por terminadores reversíveis tem como principal característica, frente a outras tecnologias, o fundamento da fragmentação de DNA com alta integridade e posterior ligação de terminadores reversíveis à porção 5’ e 3’ dos fragmentos gerados.

IV - A base do processo, em todas as metodologias de sequenciamento, para a obtenção da sequência de um genoma bacteriano completo é a fragmentação do DNA, a construção das bibliotecas e a leitura das bases. Posteriormente, o sucesso na montagem do conjunto de dados obtido, com fechamento do genoma bacteriano, está primariamente vinculado à qualidade das sequências geradas.

Quais estão corretas?

Um pesquisador pretende utilizar o banco de dados Ensembl para estudar a evolução de um gene. O objetivo é comparar a sequência de genes em diferentes espécies. O que pode ser feito para melhorar a precisão das comparações?

Um estudo randomizado buscando identificar o perfil microbiano da pele de colaboradores de diferentes setores de um hospital público foi realizado. Ao todo foram coletados suabes de pele de 300 colaboradores, sendo três sítios de coleta, totalizando 900 amostras. Considere os itens abaixo sobre o processamento dos dados obtidos, a partir de sequenciamento por Shotgun.

I - A determinação no raw dataset da qualidade das bases sequenciadas, seguida da identificação e eliminação de contaminantes.

II - A determinação nos contigs da qualidade das bases sequenciadas, seguida da identificação e eliminação de contaminantes.

III - A classificação taxonômica das sequências contra um conjunto de dados privado construído pelo próprio pesquisador.

IV - A classificação taxonômica da montagem, para posterior quantificação das ASVs (amplicon sequence variant), e observação dos índices de diversidade para cada amostra.

Quais esse processamento de dados deve prever?

Considerando a Lei nº 8.080/1990, que dispõe sobre as condições para a promoção, proteção e recuperação da saúde, a organização e o funcionamento dos serviços correspondentes e dá outras providências, no que se refere à assistência terapêutica e da incorporação de tecnologia em saúde, considere os itens abaixo.

I - Os critérios para o diagnóstico da doença ou do agravo à saúde.

II - O tratamento preconizado, sem referência a posologias.

III - Os mecanismos de controle clínico.

IV - O acompanhamento e a verificação dos resultados terapêuticos a serem seguidos pelos pacientes.

Quais dos itens acima um protocolo clínico e diretriz terapêutica deverão conter?

Sobre os conceitos em epigenética, assinale com V (verdadeiro) ou F (falso) as seguintes afirmações.

( ) Uma variante epigenética não é uma variação genética, porém pode ser herdada pelas próximas gerações.

( ) Uma variante epigenética é uma variação genética, pois altera a sequência de DNA, sendo herdada pelas próximas gerações.

( ) Uma variante epigenética determinará de modo irreversível uma mudança fenotípica.

( ) Uma variante epigenética não está relacionada à expressão de fenótipos, mas sim a mudanças genéticas herdáveis.

A sequência correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é

A Lei Geral de Proteção de Dados (LGPD) (Lei nº 13.709/2018) determina o modo e as condições em que os dados pessoais podem ser tratados, define hipóteses de tratamento, os direitos dos titulares, as obrigações e as consequências. É permitido o tratamento de dados pessoais sensíveis sem fornecimento de consentimento do titular, nas hipóteses em que for indispensável para as situações nas alternativas abaixo, EXCETO em uma delas. Assinale-a.

O GenBank é um banco de dados de sequências de nucleotídeos mantido pelo National Center for Biotechnology Information (NCBI), dos Estados Unidos. É o maior banco de dados de sequências biológicas do mundo, armazenando sequências de nucleotídeos de uma ampla variedade de organismos, incluindo bactérias, archaea, fungos, plantas, animais e humanos. Qual dos seguintes modelos de banco de dados é mais adequado para o armazenamento de sequências biológicas organizadas de forma estruturada?

Considere um projeto de pesquisa que envolve o processamento de dados WGS (Whole Genome Sequencing) de 100.000 indivíduos (genoma humano). Todas as amostras foram sequenciadas usando tecnologia WGS Illumina. O arquivo bruto (raw data) de uma única amostra possui aproximadamente 10 GB (gigabytes) de tamanho. Os dados são complexos, e as análises a serem realizadas possuem alto custo computacional em termos de processamento e uso de grandes quantidades de memória RAM. Qual das seguintes arquiteturas de computação em nuvem (cloud computing) é a mais adequada para execução do projeto e obtenção dos resultados?