Quanto às iscas envenenadas em procedimento de manejo, elas são usadas, geralmente, como complemento de outros métodos de controle; devem ser colocadas em lugares estratégicos: caminho habitual, saída de tocas e caminho de acesso a outros compartimentos do armazém. No começo, é conveniente colocadar poucas armadilhas, bem distribuídas, sendo aumentado o seu número conforme a eliminação dos roedores. Este método requer o exame diário de cada armadilha e a sua preparação para o funcionamento contínuo.

A fumigação, quando aplicada nas tocas, apresenta bons resultados. Nunca deve ser efetuada em construções habitadas pelo homem ou por animais domésticos, pois pode ser fatal. O uso de cianureto de cálcio, em doses de 30 a 50 g por toca, seguido de fechamento imediato com a mistura de cimento, terra e vidros, é muito eficiente para o combate de roedores dentro e fora dos armazéns. O bissulfeto de carbono, em doses de 30 a 60 g por toca, apresenta bons resultados, mas é inflamável e pode apresentar perigo de incêndio. Sua utilização é restrita para aplicações fora de construções ou no campo.

Os grãos armazenados são atacados por pragas (roedores, insetos e ácaros), que causam sérios prejuízos qualitativos e quantitativos. Há a necessidade de se dar a devida atenção a tais seres vivos, pois de pouco adiantam todos os cuidados e despesas para o controle dos danos na lavoura, se o produto for atacado e destruído nos depósitos. Depois da ação de pragas, restam grãos danificados que aceleram a deterioração da massa, facilitando o desenvolvimento da microflora. Além de reduzirem a qualidade, os fungos podem comprometer a sanidade dos grãos. Fungos, como o Aspergillus flavus, encontrados no amendoim e em outros grãos, produzem substâncias tóxicas denominadas aflatoxinas, que em excesso no corpo humano podem causar danos ao sistema nervoso de mamíferos e problemas no fígado, como cirrose e câncer. Apesar de a aflatoxina estar frequentemente associada ao amendoim, arroz, milho e outros grãos também podem contê-la.

Os roedores de importância em armazenamento de grãos e derivados pertencem à classe dos mamíferos, à ordem Rodentia, à família Muridae e aos gêneros Mus e Rattus. As espécies mais comuns são Mus musculus; Rattus norvegicus; e, Rattus rattus. Os ratos e as ratazanas representam um problema muito sério no processo de manejo e conservação de grãos armazenados. Estes roedores destroem produtos em quantidade dez vezes maior do que realmente podem consumir como alimento. Por serem roedores, seus dentes incisivos permitem que eles abram orifícios em uma série de materiais, como madeira, sacaria, barro, tijolos e até concreto. Sendo seus incisivos dotados de polpas persistentes, apresentam crescimento contínuo, compensando o forte desgaste a que são submetidos. Tais dentes apresentam sempre a coroa cortada em bisel, em função do tipo de desgaste. Um casal de ratos em um armazém consome cerca de 14 kg de alimento entre o outono e o inverno.

A efetividade no combate a roedores se apoia basicamente no conhecimento de sua biologia e de seus hábitos. O combate deve ser sistemático, constante e realizado de forma integrada. Além dos conhecimentos sobre biologia, hábitos, preferências alimentares, locais de reprodução e intensidade de infestação, uma parte importante na eficiência e na eficácia dos programas de controle é a identificação dos sinais de infestação, os quais incluem, principalmente, as trilhas, os derramamentos de produtos, os furos abertos em vasilhames, sacaria e/ou outros materiais no interior dos armazéns e as manchas de urina. Como os ratos costumam apresentar rotas regulares em seus movimentos, acabam produzindo pistas mais ou menos bem definidas. No interior das unidades armazenadoras, as trajetórias se evidenciam através de poeira e restos de grãos normalmente existentes no chão. A urina dos ratos normalmente apresenta fluorescência quando exposta à ação de uma lâmpada ultravioleta. Essa pode ser uma forma de detecção dos locaisonde os roedores frequentam nas infestações.