De acordo com o espectro de massas a seguir, as cargas dos íons de m/z 943,8 e 1415,2 são respectivamente:

A quantificação de biomoléculas por espectrometria de massas é sempre uma tarefa difícil. No caso de quantificação comparativa entre proteomas, em geral, utilizam-se métodos de quantificação relativa baseados em diferentes tipos de marcação química. Com o avanço tecnológico, há atualmente espectrômetros de massas que possuem alta acurácia e alta resolução mássica, além dos sistemas cromatográficos com alta reprodutibilidade, permitindo a quantificação livre de marcadores químicos (chamada de label-free quantitation). Marque a alternativa que apresenta um dos métodos de quantificação livre de marcadores químicos.

Nos protocolos de preparo de amostras proteicas para a digestão enzimática e consequente sequenciamento dos peptídeos por espectrometria de massas, utiliza-se o reagente 2-iodoacetamida para prevenir a oxidação da cadeia lateral das cisteínas presentes na sequência primária das proteínas. Como consequência, no processo de identificação das sequências primárias dos peptídeos pelo algoritmo de busca MASCOT, necessita-se selecionar o tipo de modificação química promovida pela 2-iodoacetamida nas cisteínas. A modificação fixa que deve ser selecionada é a:

MASCOT é uma ferramenta de busca poderosa que usa os dados de espectrometria de massas para identificar proteínas a partir de bancos de dados de sequência primária. Para que a identificação das proteínas pelo MASCOT seja a mais acurada possível, a busca deve ser realizada com a massa:

Na caracterização de uma nova proteína isolada de um micro-organismo, um peptídeo de razão m/z = 1560,0 foi sequenciado por espectrometria de massas e suspeitou-se que ele poderia ter uma modificação pós-traducional. Desta forma, esta mesma proteína foi incubada com uma enzima X e o mesmo peptídeo foi novamente sequenciado, mas, neste segundo experimento, ele apresentou uma razão m/z = 1480,0. A enzima X usada foi uma:

Até recentemente, a determinação da massa molecular de proteínas intactas em alta resolução por espectrometria de massas era um grande desafio. Atualmente, uma nova metodologia tem ganhado cada vez mais relevância com o avanço de equipamentos com alto poder de resolução. Esta metodologia denomina-se:

O espectrômetro de massas mostrado a seguir é formado por cinco partes principais. A parte identificada com o número 1 (um) representa o(a):

O efeito espaço-carga resulta do(a):

A injeção de gás inerte (geralmente Hélio) no analisador de massas do tipo armadilha de íons (do inglês, Ion Trap) tem a função de:

O espectro de massas a seguir é característico de: