Procedimento de auditoria ou comando consiste nas verificações e averiguações previstas em um programa de auditoria e, portanto, consideradas mandamento operacional efetivo.

A auditoria governamental possui diversas classificações, incluindo a auditoria de acompanhamento da gestão, que tem como objetivo atuar em tempo real sobre os atos efetivos e os efeitos de uma unidade federal.

Considere a seguinte situação hipotética. O governo federal, por meio de convênio, repassou recursos para determinado governo estadual. Esses recursos foram alocados à empresa vencedora do certame para a construção de um duto, cujo objetivo era abastecer vários bairros. Nessa situação, compete à auditoria comprovar a legalidade e legitimidade desses atos e fatos administrativos, bem como sua eficácia em qualquer esfera de governo e níveis de poder, excetuando as entidades de direito privado.

Compete ao sistema de controle interno do poder executivo federal, por intermédio da técnica de auditoria, realizar auditoria nos processos de tomadas de contas especiais, quando houver prática de ato antieconômico que cause dano ao erário, visando apurar os fatos.

Cabe à auditoria governamental observar os aspectos relevantes do programa federal Fome Zero, considerando que o objetivo principal desse tipo de auditoria é garantir resultados operacionais na gerência da coisa pública.

O relatório é o documento pelo qual a auditoria interna apresenta, a quem tenha solicitado, o resultado dos seus trabalhos, e deve abordar aspectos como limitações e evidências encontradas. Caso haja necessidade, é possível emitir relatório parcial.

Considere que uma empresa perdeu uma causa trabalhista na justiça que envolve grande vulto e a administração da empresa não tomou conhecimento antecipado dessa situação. Nesse caso, a falha foi do controle interno e não da auditoria interna, considerando que tal situação envolve, sobretudo, o setor jurídico da empresa, que é acompanhado pelo controle interno.

Um empréstimo creditado na conta corrente e confirmado no extrato bancário, mas não contabilizado pela empresa, deve ser apresentado na reconciliação bancária, procedimento de auditoria, como redução do saldo do razão.

Os procedimentos de auditoria interna incluem os testes de observância e os testes substantivos. Nos testes substantivos, o auditor interno deve aplicar os procedimentos de revisão analítica.

No planejamento da auditoria interna, devem-se considerar fatores relevantes na execução dos trabalhos como a natureza, a oportunidade e a extensão dos procedimentos de auditoria; porém, o uso do trabalho de especialistas somente deve ser adotado em auditorias externa.