Para o monitoramento da tubulação de vácuo em um sistema UHV (ultra-high vacuum), a coleta de material deve ser feita a montante da primeira válvula de isolamento de vácuo, do lado de dentro da parede de proteção.

As espécies de gases residuais problemáticos freqüentemente encontrados incluem o oxigênio, o vapor de água e hidrocarbonetos.

Alterações nas concentrações de gases residuais não afetam processos em escala macro que ocorrem em um sistema de vácuo.

O termo gases residuais refere-se a gases que permanecem em um sistema de vácuo quando a maior parte da atmosfera que ocupava esse sistema foi previamente bombeada para fora. Embora esses gases possam estar presentes em concentrações traços, a sua presença ainda pode ser proibitiva para muitos processos industriais ou experimentos de pesquisa, em que a virtual ausência de gases residuais é condição prévia de sucesso.

Um ambiente limpo deve ter o mínimo de compartimentalização possível.

Uma pressão positiva deve ser adotada dentro da sala limpa para manter a contaminação externa — partículas e umidade — fora desse ambiente. Todavia, uma pressurização negativa pode ser utilizada quando for necessário manter materiais perigosos dentro da sala limpa.

Dependendo do nível de limpeza requerido e das condições do ambiente, pode ser necessário utilizar um filtro de ar, que dilui constantemente as partículas já existentes ou emitidas para dentro da sala limpa, ou um sistema de fluxo laminar, capaz de criar uma varredura constante das partículas da sala.

Uma sala limpa é uma área fechada especialmente construída para manter um ambiente controlado com respeito a partículas aerotransportadas, temperatura, umidade, pressão do ar, movimentação do ar, vibrações, ruídos e iluminação.

Na eluição isocrática, a composição da fase móvel permanece constante ao longo de toda a separação.

Dois problemas tendem a encurtar a vida de uma coluna analítica. Primeiro, solutos que se ligam irreversivelmente à fase estacionária podem degradar o desempenho da coluna e diminuir a fase estacionária disponível. Segundo, materiais particulados injetados com a amostra podem entupir a coluna analítica. Para minimizar esses problemas, pode-se usar uma pré-coluna (guard column), posicionada antes da coluna analítica. Normalmente, essas pré-colunas contêm o mesmo material particulado empacotado e a mesma fase estacionária da coluna analítica, mas são significativamente menores e mais baratas.