A identificação de fungos a partir de uma amostra biológica pode ser realizada por __________, através da análise da região __________ do __________.

Assinale a alternativa que preenche, correta e respectivamente, as lacunas da frase acima.

A técnica de microarranjo pode ser utilizada para todas as aplicações abaixo, EXCETO:

Sobre a técnica de sequenciamento de nova geração (NGS – Next-Generation Sequencing), considere as afirmações abaixo.

I - Análise de região hipervariável do gene 16S, RNA-seq, identificação de mutações de ponto a partir de DNA de sangue periférico e montagem de novo de genomas são aplicações da técnica.

II - DNA livre de célula ou cell-free DNA não pode ser analisado por NGS.

III - A sensibilidade do NGS para detecção de variação de nucleotídeo único é acima de 5%.

IV - A amostra de DNA precisa ser quantificada por espectrofotometria, não sendo necessária a análise por fluorimetria (uso de reagente Qubit ou Picogreen).

Quais estão corretas?

Assinale a alternativa INCORRETA em relação ao sequenciamento de nova geração (NGS – Next-Generation Sequencing).

Numere a segunda coluna de acordo com a primeira, relacionando etapas ou arquivos da análise de sequenciamento de nova geração (NGS – Next-Generation Sequencing) a suas respectivas características.

(1) Anotação de variantes

(2) Arquivo formato BAM

(3) Mapeamento/Alinhamento

(4) Profundidade de cobertura

(5) Arquivo formato VCF

( ) Lista de variantes de sequência identificadas após a comparação contra um genoma de referência.

( ) Número de vezes em que um nucleotídeo ou fragmento de DNA é sequenciado.

( ) Obtenção de informações sobre os efeitos biológicos, mas não obrigatoriamente clínicos ou funcionais das variantes.

( ) Dados de sequenciamento após o alinhamento contra um genoma de referência.

( ) Comparação das sequências lidas contra um genoma de referência, para determinar o local ao qual aquela sequência pertence.

A sequência correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é

Sobre bancos de dados públicos para análise de bioinformática, assinale com V (verdadeiro) ou F (falso) as afirmações abaixo.

( ) O Protein Data Bank (PDB) armazena informações sobre a estrutura de proteínas e ácidos nucleicos.

( ) A Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) arquiva genomas individuais, produtos de genes e suas funções, além de integrar informações bioquímicas e genéticas.

( ) O Gene Expression Omnibus (GEO) contém somente dados de microarranjo depositados.

( ) O Ensembl armazena dados sobre o genoma humano, o que inclui genes, SNPs, repetições e homologias. Apenas genes identificados experimentalmente podem ter seus dados depositados.

A sequência correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é

Sobre boas práticas de laboratório, assinale com V (verdadeiro) ou F (falso) as afirmações abaixo.

( ) As diluições simples e as diluições seriadas são utilizadas para reduzir a concentração de um reagente/analito e recomenda-se que sejam feitas colocando-se o solvente diretamente em um tubo já contendo solução estoque (concentrada).

( ) Para preparar uma solução 0,1 M deve-se pesar 10% do peso molecular da substância e diluir em 100 mL do solvente apropriado.

( ) É recomendado que a identificação de amostras biológicas de pesquisas científicas com seres humanos não contenha nome de paciente ou algum outro dado identificador do paciente. Recomenda-se a utilização de siglas ou sequência de números únicos que remetam a um banco de dados com acesso restrito.

( ) Para armazenamento de amostras biológicas, a longo prazo, recomenda-se a utilização de ultrafreezers (-80°C), podendo as amostras serem descongeladas e recongeladas várias vezes para a realização dos experimentos e testes necessários, não havendo prejuízo para as análises posteriores.

A sequência correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é

Sobre a metodologia Luminex, assinale com V (verdadeiro) ou F (falso) as afirmações abaixo.

( ) É usada para a detecção simultânea de mais de um analito (multiplex), mas com gasto de grande quantidade de amostra (mais de 500 \( \mu \)L).

( ) Utilizando proporções precisas de fluoróforos, podem ser criados até 100 conjuntos diferentes de microesferas para análise de diferentes analitos, no equipamento LUMINEX^® 100/200™, e até 500 analitos, no equipamento FLEXMAP 3D^®.

( ) Os kits de microesferas com fluoróforos para Luminex se fundamentam na técnica de qPCR (PCR em tempo real).

( ) O equipamento LUMINEX^® 100/200™ movimenta as esferas uma a uma, através de feixe único de laser, como em um citômetro de fluxo.

A sequência correta de preenchimento dos parênteses, de cima para baixo, é

Western blot é um método para detectar proteínas em homogenato, extrato de tecido ou cultura de células.

Observe os itens abaixo.

(1) Incubação com anticorpo primário.

(2) Extração/purificação das proteínas.

(3) Realização de eletroforese em gel de poliacrilamida.

(4) Transferência para membrana.

(5) Incubação com anticorpo secundário.

(6) Revelação/detecção do imunoconteúdo.

(7) Bloqueio da membrana.

A alternativa que contém a ordem correta e sequencial de realização dos passos da técnica de Western blot é

Analise o gráfico abaixo de amplificação de PCR em tempo real na escala log.

Considerando que o Ct da curva A é 17 e o da curva B é 21, assinale a alternativa correta.