Os processos de produção de cana-de-açúcar têm sido racionalizados em decorrência da economia de escala, da eficiência das máquinas de colheita e do aproveitamento de resíduos, tanto na fertilização de solo quanto na co-geração de energia. Entretanto, impactos ambientais decorrentes de extensas áreas com monocultivo de cana-de-açúcar continuam sendo importante questão de pesquisa.

A poda, a mecanização, o sombreamento e a competição entre plantas por água e por outros nutrientes do solo são aspectos cruciais a serem observados no manejo de sistemas agroflorestais para fins energéticos.

Sistemas de produção agroenergéticos possibilitam a utilização integrada de espécies (anuais, bianuais e perenes) para usos múltiplos, e apresentam vantagens, como a minimização de processos de erosão de solo e a reciclagem de nutrientes das camadas superficiais do solo para as mais profundas.

No Brasil, a produção do biodísel vem sendo impulsionada com a priorização dos cultivos de dendê na região Norte e da mamona nas regiões Nordeste e Sul.

Entre as matérias-primas agroenergéticas já estudadas, encontram-se, em ordem decrescente de competitividade econômica, o óleo de fritura, o sebo bovino, o óleo de soja e o óleo de mamona. Entretanto, o cultivo de dendê apresenta-se como a alternativa agrícola de maior produção de óleo por hectare.

O pinhão-manso (Jatropha curcas L.) é uma planta anual, da família Euphorbiaceae, indicada para produção de biodiesel em sistemas agroflorestais.

Entre as etapas de pesquisa orientadas para processo ou pesquisa de sistemas, incluem-se descrição da situaçãoproblema, identificação de transformações relevantes do sistema, redução do problema, modelagem do sistema, comparação de modelos com a realidade, discussão de mudanças desejáveis e viáveis, validação dos resultados e melhoria da problemática.

As pesquisas em campos experimentais constituem uma das etapas do processo de geração de tecnologias de produção de biomassa.

A taxa de acúmulo de biomassa de uma planta pode ser calculada como a soma do crescimento e da senescência dos tecidos dessa planta.